146368-16-3|Cy3-N-羥基琥珀酰亞胺酯
產(chǎn)品描述:
Cyanine3(Cy3),是花青素?zé)晒馑厝玖霞易宓某蓡T之一,是化學(xué)合成的聚甲炔染料。目前Cyanine系列染料以兩種異構(gòu)體的形式供貨,一種是非磺化花青素(non-sulfonated cyanines),一種是磺化花青素(sulfonatedcyanine)。兩者的光譜性質(zhì)幾乎*,因此大部分應(yīng)用可相互替換,比如,都可用于標(biāo)記DNA或蛋白等生物分子。兩者的主要區(qū)別在于:磺化染料是水溶性的,在水相的標(biāo)記反應(yīng)體系內(nèi)不需要使用有機(jī)共溶劑,并且降低染料在水中聚集的可能性,增強(qiáng)標(biāo)記效率。
本Cy3 NHS ester,即含N-羥基琥珀酰亞胺(N-Hydroxysuccinimide)活化基團(tuán)的Cy3,可直接與生化分子上的氨基(-NH2)反應(yīng)形成穩(wěn)定的酰胺鍵,主要是伯胺。
146368-16-3|Cy3-N-羥基琥珀酰亞胺酯
一般特性:
外觀: | red powder |
質(zhì)譜分析M+增量: | 474.2 |
分子量: | 590.15 |
分子式: | C34H40ClN3O4 |
溶解性: | soluble in organic solvents (DMF, DMSO, dichloromethane), insoluble in water |
質(zhì)量控制: | NMR 1H and HPLC-MS (95%) |
儲存條件: | Storage: 24 months after receival at -20°C in the dark. Transportation: at room temperature for up to 3 weeks. Avoid prolonged exposure to light. Desiccate. |
光譜特性:
zui大激發(fā)波長, nm: | 555 |
在zui大激發(fā)波長下的消光系數(shù), Lmol-1cm-1: | 150000 |
zui大發(fā)生波長, nm: | 570 |
熒光量子產(chǎn)率: | 0.31 |
運(yùn)輸和保存方法:
冰袋運(yùn)輸。-20℃干燥避光保存,有效期1年。
注意事項(xiàng)
1)NHS ester基團(tuán)對濕度非常敏感,務(wù)必干燥保存產(chǎn)品。使用前產(chǎn)品需放到室溫回溫至少20min。
2)NHS ester基團(tuán)的水解發(fā)生在水溶性緩沖體系屬于競爭性反應(yīng)。對蛋白/多肽(濃度:1-1mg/ml)伯胺的連接反應(yīng)建議在pH 7-9范圍內(nèi)進(jìn)行。使用不含氨基的緩沖體系,pH 7-9。比如100 mM 磷酸鈉,150 mM 氯化鈉, pH7.5; 100mM Hepes, pH 7.5。100 mM 碳酸鈉/碳酸氫鈉, pH 8-9;或100mM硼酸緩沖液, pH 8-9。
3)不要使用含伯胺的任何緩沖液,比如Tris,甘氨酸。
4)為了您的安全和健康,請穿實(shí)驗(yàn)服并戴一次性手套操作。
使用方法:(用Cy3-NHSEster 標(biāo)記抗體)
【注意】:可參考本方法進(jìn)行多肽,蛋白或者其他分子的標(biāo)記,需要根據(jù)具體的實(shí)驗(yàn)體系對合適的標(biāo)記緩沖體系,樣本濃度,染料濃度等參數(shù)做出合適的調(diào)整。
1)用不含氨基的合適的緩沖液(eg.100mM磷酸鈉,150mM NaCl, pH7.5)溶解抗體使其濃度達(dá)到1-5mg/ml?!咀ⅰ浚喝缈贵w中有殘留Tris或 glycine 污染,則需透析或者脫鹽到合適的緩沖液內(nèi)。
2)使用前,用適量去離子水或者無水DMSO溶解Cy3-NHS,使其摩爾濃度為抗體摩爾濃度的400倍,例如,待標(biāo)記的IgG濃度為1mg/ml(eg 6.7μM),則溶解后Cy3-NHS的濃度為2.7mM;如待標(biāo)記的IgG濃度為2.5mg/ml,則溶解后Cy3-NHS的濃度為6.75mM;
3)向抗體中加入適量Cy3-NHS試劑,以達(dá)到預(yù)期的標(biāo)記效率?!咀ⅰ浚寒?dāng)用Cy 3 NHS ester標(biāo)記抗體或其他蛋白,亮度zui高的偶聯(lián)物其染料/蛋白的比率為4-12,取決于特定的應(yīng)用。過高比率會增加非特異性背景,喪失抗體特異性結(jié)合,導(dǎo)致聚集。建議根據(jù)應(yīng)用優(yōu)化標(biāo)記比率。
4)室溫孵育60min(或更長);
5)利用合適緩沖液透析或脫鹽柱去除未反應(yīng)的試劑;
6)分別在280nm和550nm檢測Cy3-抗體的吸光值;
7)測定Cy3標(biāo)記效率(DOL)和標(biāo)記濃度。見下公式。
公式一. 利用下面公式計(jì)算Cy3標(biāo)記效率(DOL)及其濃度(mg/ml) |
E.1 Number of Cy3 dye per protein=molarity Cy3 dye / molarity protein |
E.2 [Molarity of Cy3 dye]=A555/ε555 |
E.3 [Molarity of protein]=A280C/ε280 |
E.4 mg/ml=[A280-(A555×0.08)/(E1%/10)]×dilution factor |
【注】上述參數(shù)如下: A555=conjugate absorbance at 555±2nm ε555=molarextinction coefficient Cys dye =150000M-1cm-1 A280= conjugate absorbance at 280nm A280C =corrected conjugate absorbance at 280nm= A280-( A555×0.08) ε280= molarextinction coefficient protein(M-1cm-1)=MWp×E1%/10 |
其它染料列表:
N-羥基琥珀酰亞胺脂Dye NHS esters
Pyrenebutyric acid NHS ester
ROX NHS ester, pure 6- isomer
BDP FL NHS ester
FAM NHS ester
Cyanine3 NHS ester
Cyanine3.5 NHS ester
Cyanine5 NHS ester
Cyanine5.5 NHS ester
Cyanine7 NHS ester
Cyanine7.5 NHS ester
Sulfo-Cyanine3 NHS ester
Sulfo-Cyanine5 NHS ester
sulfo-Cyanine5 bis-NHS ester
Sulfo-Cyanine7 NHS ester
馬來酰亞胺 Dye maleimides
Pyrene maleimide
BDP FL maleimide
Cyanine3 maleimide
Cyanine5 maleimide
Cyanine5.5 maleimide
Cyanine7 maleimide
Cyanine7.5 maleimide
Sulfo-Cyanine3 maleimide
Sulfo-Cyanine5 maleimide
伯胺 Primary amine
BDP FL amine
Cyanine3 amine
Cyanine5 amine
Cyanine5.5 amine
Cyanine7 amine
Cyanine7.5 amine
Sulfo-Cyanine5 amine
Sulfo-Cyanine7 amine
酰肼 Dye hydrazides
Pyrene hydrazide
BDP FL hydrazide
Cyanine3 hydrazide
Cyanine5 Boc-hydrazide
Cyanine5 hydrazide
Cyanine5.5 hydrazide
Cyanine7 hydrazide
Cyanine7.5 hydrazide
馬來酰亞胺 Dye maleimides
BDP FL maleimide
Cyanine3 maleimide
Cyanine5 maleimide
Cyanine5.5 maleimide
Cyanine7 maleimide
Cyanine7.5 maleimide
Sulfo-Cyanine3 maleimide
Sulfo-Cyanine5 maleimide
羧酸 Carboxylic acids
Pyrenebutyric acid
BDP FL carboxylic acid
Cyanine3 carboxylic acid
Cyanine3.5 carboxylic acid
Cyanine5 carboxylic acid
Cyanine5.5 carboxylic acid
Cyanine7 carboxylic acid
Cyanine7.5 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine3 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine5 carboxylic acid
Sulfo-Cyanine7 carboxylic acid
點(diǎn)擊化學(xué)試劑
非熒光炔烴 Non-fluorescent alkynes
Pentynoic acid STP ester
Biotin alkyne
非熒光疊氮化物 Non-fluorescent azides
Azidobutyric acid NHS ester
Biotin azide
寡核苷酸分析
亞磷酰胺 Phosphoramidites
FAM Phosphoramidite, 6-Isomer
Alkyne Amidite, hydroxyprolinol
Alkyne Phosphoramidite, 5'-terminal
DMS(O)MT aminolink C6
Long trebler phosphoramidite
Pyrene phosphoramidite dU
PCR/PCR PCR/PCR
ROX reference dye for PCR
SYBR Green I Gel Staining Solution, 10000x
SYBR Green I for Real Time PCR, 100x
CPG固相修飾 CPG solid supports
Alkyne CPG modifier 500
TFA-Amino modifier CPG 500
三磷酸酯修飾 Modified triphosphates
Ami1-ddUTP
Ami1-dUTP