詳細(xì)介紹
PromethION是一款桌面測(cè)序儀,利用的納米孔測(cè)序技術(shù),實(shí)現(xiàn)對(duì)DNA和RNA分子的高通量單分子實(shí)時(shí)測(cè)序。
1.應(yīng)用廣泛:全基因組測(cè)序、靶向測(cè)序、RNA測(cè)序、宏基因組測(cè)序、表型研究等。樣本類型包括人類基因組、動(dòng)植物基因組、微生物基因組以及各種臨床標(biāo)本的DNA和RNA
2.測(cè)序起始量需求從pg級(jí)到ug級(jí)都可以進(jìn)行建庫。
3.配合快速建庫試劑盒使用,可以在10分鐘之內(nèi)完成文庫的制備。
4.集成設(shè)備:PromethION本身集成了一臺(tái)高性能計(jì)算機(jī),可用于數(shù)據(jù)獲取,存儲(chǔ)以及堿基轉(zhuǎn)換(basecalling。
5.安裝簡(jiǎn)便:沒有復(fù)雜的激光或光路系統(tǒng),插電即可使用。
6.產(chǎn)生數(shù)據(jù)快速:提供的單分子實(shí)時(shí)測(cè)序,上機(jī)后2分鐘產(chǎn)生堿基序列數(shù)據(jù)。并可以根據(jù)實(shí)驗(yàn)需求設(shè)置測(cè)序反應(yīng)時(shí)間,可選范圍在幾分鐘到48小時(shí)之間。
7.模塊化設(shè)計(jì):允許同時(shí)運(yùn)行多至48個(gè)獨(dú)立的實(shí)驗(yàn),也可以單獨(dú)運(yùn)行1個(gè)測(cè)序?qū)嶒?yàn),為用戶提供了實(shí)驗(yàn)設(shè)計(jì)上的便利。
8.單分子測(cè)序:DNA/RNA直接測(cè)序,無需PCR擴(kuò)增,免除PCR擴(kuò)增帶來的錯(cuò)誤和GC偏差,DNA平均測(cè)序速度為450bp/s,快速、實(shí)時(shí)。
9.讀長(zhǎng)長(zhǎng):讀長(zhǎng)為核酸片段長(zhǎng)度,最長(zhǎng)超過2Mbp。
10.數(shù)據(jù)量大:?jiǎn)螐埿酒a(chǎn)生200G數(shù)據(jù),48張芯片可產(chǎn)生48*200G數(shù)據(jù)。
11.直接RNA測(cè)序:提取RNA無需轉(zhuǎn)換成cDNA即可進(jìn)行測(cè)序。
12.甲基化檢測(cè):堿基修飾基于電信號(hào)的差異檢測(cè)堿基,在DNA/RNA測(cè)序同時(shí)可直接檢測(cè)堿基修飾。
13.分析軟件豐富:數(shù)據(jù)分析工作站預(yù)先安裝了30多種可用于分析Nanopore測(cè)序數(shù)據(jù)的常用工具。