運用高通量熒光定量PCR方法,在一張96孔或384孔板上同時對某個信號通路或疾病相關(guān)基因的多個基因的表達(dá)量變化進(jìn)行檢測,芯片上的基因包括了與研究對象有確定關(guān)系的基因或者待考證的基因;目前啟因生物針對不同的信號通路和疾病相關(guān)基因設(shè)計了150多款功能分類芯片,涵蓋生命科學(xué)研究的各個領(lǐng)域。
Real-time PCR arrays are tools that allow convenient testing of samples in many assays concurrently, parallel testing of many samples or testing of multiple samples and targets simultaneously.
——Saunders N A(2013)
檢測項目:腫瘤相關(guān)基因 PCR芯片、多種信號通路相關(guān)基因 PCR芯片、miRNA 、lncRNA ;
芯片特點:任意基因組合、樣品數(shù)目不限、多樣品數(shù)據(jù)分析;
芯片價格:
15元一個反應(yīng);
比如: ·檢測50個基因/一個樣品:50*1*15 (750元)
·檢測84個基因/兩個樣品:84*2*15(2520元)
·檢測300個基因/一個樣品:300*1*15(4500元)
檢測流程:
1. 樣品RNA提?。?br /> 2. RNA質(zhì)量檢測,檢測RNA純度及完整度,提供RNA質(zhì)量報告;
3. cDNA合成,使用逆轉(zhuǎn)錄酶,將樣品RNA逆轉(zhuǎn)錄為cDNA;
4. 實時定量PCR反應(yīng);
5. 數(shù)據(jù)分析,計算中的各個Ct值,采用ΔΔCt方法比較基因的表達(dá)變化,并利用公司自主開發(fā)的數(shù)據(jù)分析軟件進(jìn)行比較。
啟因生物可提供上百種不同信號通路和疾病相關(guān)基因功能分類的,種屬包括人、小鼠、大鼠等,格式分為96孔和384孔兩種,并且還有個性化定制芯片服務(wù)。
應(yīng)用實例:
[1] Hung T, Wang Y, Lin M F, et al. Extensive and coordinatedtranscription of non-coding RNAs within cell-cycle promoters[J]. Nature genetics, 2011, 43(7): 621-629.