AP/MALDI 基于高重頻二極管泵浦全固態(tài) (DPSS) 紫外晶體激光器，使離子化高效、連續(xù)、穩(wěn)定，調(diào)諧簡(jiǎn)便易行，與各種質(zhì)譜分析器相連，適于多肽、蛋白、核酸、唾液酸、低聚糖、表面活性劑、聚合物大分子，以及氨基酸、寡肽、中性寡糖等小分子化合物的原位、直接分析。空間分辨率達(dá) 5μm（微米）以下。
AP/MALDI 與“真空 MALDI” 工作原理基本相似，以低熔點(diǎn)的小分子有機(jī)物做基質(zhì)，吸收激光能量，在其脫附成氣態(tài)進(jìn)入氣相的過程中發(fā)生電離，生成基質(zhì)離子。中性待測(cè)分析物與基質(zhì)離子發(fā)生氣相中的質(zhì)子交換或電子遷移并離子化，進(jìn)入質(zhì)譜而被檢測(cè)。
AP/MALDI 與“真空 MALDI” 不同之處在于 AP-MALDI 的離子化發(fā)生在大氣壓下，由于帶電離子通過與輔氣分子碰撞達(dá)到熱平衡，形成較穩(wěn)定的電子云，電離更柔和，能夠提供穩(wěn)定離子流，為連續(xù)電離源。另外，點(diǎn)樣及換樣過程發(fā)生在大氣壓狀態(tài)，不需要（像真空 MALDI 那樣）切換真空，為現(xiàn)代原位電離源之一，實(shí)際操作和使用非常便捷。
同時(shí)，AP MALDI 更允許使用非揮發(fā)性以及揮發(fā)性溶劑溶解樣品。某些熱不穩(wěn)定化合物在真空條件下由于激光灼熱引發(fā)的分解，將能在大氣壓狀態(tài)下由空氣對(duì)流冷卻而加以避免。同時(shí)，AP/MALDI 的兼容性也遠(yuǎn)遠(yuǎn)好于“真空 MALDI”，與各個(gè)廠家多種類型的質(zhì)譜儀（串四極桿、離子阱、TOF、QTOF、Orbitrap、FT 等等）兼容，并能實(shí)現(xiàn)與原有離子源地快速互換。
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