E3連接酶配體-linker偶聯(lián)物| E3連接酶配體連接子偶聯(lián)物 | PROTAC 連接子
PROTAC是一種異雙功能分子,分子的一端連接結(jié)合靶蛋白的配體,一端連接E3連接酶的配體,中間通過合適的Linker相連。PROTAC降解靶蛋白是通過泛素蛋白酶體系統(tǒng)(UPS)實現(xiàn)的,其大致過程如下,PROTAC分子結(jié)合靶蛋白(POI)和E3連接酶,形成三元復(fù)合物,給靶蛋白打上泛素化的標(biāo)簽,泛素化的蛋白被細(xì)胞內(nèi)的蛋白酶體26S識別并降解。
PROTAC的優(yōu)勢
1) 作用范圍更廣、活性更高、可靶向“不可成藥”靶點
2) 提高選擇性、活性和安全性
3) 克服藥物的耐藥性
PROTAC因為其uinque優(yōu)勢和作用機(jī)制,受到廣泛關(guān)注。如何設(shè)計并通過高效的評價體系來發(fā)現(xiàn)高效的PROTAC是新藥開發(fā)的重中之重。盡管目前PROTAC被研究的很多,涉及的靶點也很多,但是構(gòu)效關(guān)系仍然不是很明確。
從PROTAC的結(jié)構(gòu)特點出發(fā),其設(shè)計的考慮因素主要有以下幾點。
1) POI配體的選擇
POI配體一般選擇上市或者文獻(xiàn)報道的具有一定活性的抑制劑,按照抑制劑能否形成共價鍵,可分為可逆抑制劑、共價不可逆抑制劑和共價可逆抑制劑。根據(jù)結(jié)合口袋的不同,又可分為ATP競爭性抑制劑和變構(gòu)抑制劑。為了獲得具有知識產(chǎn)權(quán)的PROTAC,常常先對抑制劑做一定的結(jié)構(gòu)衍生,使用優(yōu)化后的抑制劑作為POI的配體。
2) E3連接酶及其配體的選擇
PROTAC中的E3連接酶主要有CRBN、VHL、cIAP和MDM2。效果較好、使用頻次最高的E3連接酶主要是CRBN和VHL兩種。其中,CRBN的配體主要是 lenalidomide、 及其類似物,VHL的配體主要是VHL-L。
3) Linker的選擇
根據(jù)Linker構(gòu)成的不同,主要可分為烷基鏈和PEG鏈,常用的Linker長度一般在4~15個碳原子(或雜原子)。根據(jù)作用靶點的不同,Linker的長短對降解活性的影響也不同。此外,Click chemistry(點擊化學(xué))由于反應(yīng)條件較溫和、效率較高,常常被應(yīng)用到PROTAC分子的Linker當(dāng)中,用于連接兩端的分子。
碳水科技(Tanshtech)專注于PROTAC Linker(E3連接酶-PEG Linker)的研發(fā),提供具有各種活性基團(tuán)的高純度PEG linker(E3連接酶-Linker),歡迎廣大朋友與我們溝通交流!
碳水科技(Tanshtech)提供的部分PROTAC Linker(E3連接酶-PEG Linker)
Thalidomide -PEG linker
Thalidomide-O-PEGn-amine
Thalidomide-O-amido-PEG4-NH2
Pomalidomide-PEG linker
Pomalidomide-PEGn-amine/COOH/SH/N3/CHO/Tos/Ms/Alkyne/ piperazine
Pomalidomide-NH-PEG4-amine/COOH/SH/N3/CHO/Tos/Ms/Alkyne/ piperazine
(S,R,S)-AHPC-PEG linker
(S,R,S)-AHPC-PEGn-Alkyne/Azide/NH2/SH
(S,R,S)-AHPC-PEG4-Alkyne/Azide/NH2/SH
Diketone-PEG linker
Diketone-PEGn-PFP ester/Biotin/DBCO/Diketone
Diketone-PEG4-PFP ester/Biotin/DBCO/Diketone
AZD-PEGn- linker
AZD-PEGn-Acid/ Methyl ester/PFP/Azide
AZD-PEG4-Acid/ Methyl ester/PFP/Azide
PEG Linkers
N3-PEG3-CH2CH2COOH | 1056024-94-2 |
Bis-PEG9-acid | 1268488-70-5 |
Amino-PEG4-CH2COOH | |
Boc-NH-PEG2-CH2CH2COOH | 1365655-91-9 |
NH2-PEG2-C2-Boc | 756525-95-8 |
Amino-PEG4-alcohol | |
Amino-PEG4-CH2COOH | |
NH2-PEG2-C2-Boc | 756525-95-8 |
Amino-PEG4-alcoho | l86770-74-3 |
NH2-PEG3-COOH | |
NH2-PEG2-COOH | |
DBCO-PEG12-PA | |
COOH-PEG6-COOH |